Vemos los créditos finales..... Snake, Otacon, Liquid......¿Big Boss?....
Enseguida vemos como Snake no se atrevió a pegarse el tiro, de rodillas deja caer el arma a un lado.... mientras se escucha.....Muy bien....., poco a poco se deja ver la persona que le habla a Solid Snake....Es Big Boss... y junto a él en silla de ruedas y vegetal....Zero. Snake se queda perplejo al ver a su "padre" junto a su lado, enseguida Snake le ataca y ambos hacen un poco de CQC.... pero Big Bosslo desarma....para abrazarse a su "hijo" y decirle que deje de luchar ya. Big Boss le explica a Snake que el cuerpo que poseía EVA era un clon suyo, un clon PERFECTO.....SOLIDUS SNAKE..... por eso "Liquid" no notó la diferencia....salvo en el detalle del parche del ojo...(el cuál el menda se dió cuenta XD). A Big Boss lo reconstruyeron con partes del cuerpo de Solidus y Liquid, y estuvo durante mucho tiempo en un estado de "espera". Una vez destruido el GW Big Boss volvió en si (puede que me confunda un poco, pero no es para menos... con tanta información de golpe XD), Zero era el causante de todo, y con el final de Zero, todo volvería a la normalidad.... de momento, ya que según Big Boss, alguien vendrá que bueno te hará (bueno eso es mio XD), Los Patriots son ahora una máquina que actua automáticamente (o lo era), por eso Big Boss le corta el oxígeno a Zero para que todo acabe.
Pero antes de llegar al fin, Big Boss le desvela a Snake que el nuevo FOXDIE que lleva consigo fué lo que mató a Liquid, Eva... y lo que matará al mismo Big Boss.... antes de morir Big Boss le desvela a Snake un último descubrimiento de Naomi. El nuevo FOXDIE que Snake tiene, está venciendo al viejo, por lo que Snake ya no será una amenaza andante. Aunque sigue teniendo un FOXDIE dentro de si, vivirá ese virus lo que Solid Snake viva, ni más ni menos. Antes de morir junto a la tumba de The Boss, Big Boss le recomienda a su hijo, que viva lejos de la batalla, él, the boss, liquid y Solidus murieron peleando, pero que él era distinto, él era el "Ganador". Big Boss intenta encender un puro mientras derrama una lágrima, Snake se lo enciende y se lo pone en la boca, antes de que Big Boss muera....
Como es lógico, al final de los créditos conversación al canto, pero nada del otro mundo, Otacon y Snake hablan, Snake va a dejar de fumar y a retirarse a vivir lo que le quede... Otacon sin entrar a razones le dice a Snake que le seguirá hasta el final.....ambos tienen que comerse los huevos que cocina Sunny......